Komitet Monitorujący Szwajcarsko-Polski Program Współpracy w wyniku głosowania w trybie procedury obiegowej, zatwierdził 9 kwietnia 2009 r. kryteria oceny merytorycznej projektów w obszarze tematycznym Ochrona zdrowia, cel I - Promocja zdrowego trybu życia oraz zapobieganie chorobom zakaźnym na poziomie krajowym i na obszarach koncentracji geograficznej oraz w obszarze tematycznym Badania i rozwój.
Ze względu na specyficzny charakter sektora objętego wsparciem w ramach wyżej wymienionego Celu I obszaru tematycznego Ochrona zdrowia, z dostępną alokacją do 12 mln CHF, obowiązuje procedura pozakonkursowa z podejściem programowym. Ministerstwo Zdrowia uczestniczy w procesie identyfikacji programów kwalifikujących się do uzyskania wsparcia.
W ramach obszaru tematycznego Badania i rozwój, z dostępną alokacją do 18 mln CHF, realizowane będą wspólne projekty badawcze i partnerstwa instytucjonalne w ramach Polsko – Szwajcarskiego Programu Badawczego. Na wniosek Ministerstwa Nauki i Szkolnictwa Wyższego oraz po konsultacjach ze stroną szwajcarską projekty w ramach powyższego Programu będą realizowane w obrębie następujących 5 obszarów badawczych: ICT (Information and Communication Technology), Energia – odnawialne źródła energii, Nanotechnologie, Zdrowie, Środowisko.
Obecnie trwają zaawansowane prace programowe zmierzające do uruchomienia naboru dla ww. projektów w III/IV kwartale 2009 r.